ImageJ – egy szoftver elemzi és feldolgozza a képfájlokat. A szoftver képes hatékonyan elemezni a képet, és megkapja a részletes műszaki adatokat. ImageJ támogatja a legtöbb képformátumot és egy sor szerkesztő eszközök. A szoftver lehetővé teszi, hogy készítsen a különböző geometriai transzformációk, hozza létre a sűrűség hisztogram, magatartás 3D-s megjelenítés, végezze el a logikai és aritmetikai műveletek a képek között, stb ImageJ képes egyszerre dolgozni több kép, alkalmazza a különböző szűrők és végezze el a kötegelt feldolgozása fájlokat. ImageJ tartalmaz sok plagins hogy jelentősen meghosszabbítja a szoftver képességeit.