FileZilla Server – erőteljes FTP kiszolgáló a fejlett szolgáltatáskészletekkel. A szoftver olyan kiszolgálóból áll, amely rendszer szerverként és alkalmazásként működik a távoli hozzáférés támogatásával, amely kezeli ezt a kiszolgálót. A FileZilla Server támogatja az RTP, az SFTP és az FTPS protokollokat, és megbízható adatvédelmi szintet nyújt az SSL titkosításnak köszönhetően. A FileZilla Server lehetővé teszi a felhasználók hozzáférését a kiszolgálóhoz, blokkolja a letöltéseket a szerverekről vagy belső IP-címekről, módosítja a továbbított fájlok tömörítési arányát, korlátozza a maximális letöltési sebességet stb. A FileZilla Server összegyűjti a tevékenység statisztikáját az FTP-n-server valós időben, amely lehetővé teszi azon felhasználók azonosítását, akik jelenleg fájlokat töltenek le vagy illegális műveleteket végeznek.